Cell Res：沈阳基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和双链 DNA 分成的特殊核酸骨架，在脱氧核糖核酸和真核生物动物的蛋白质组中分布为广泛且都有。R-loop 在很多更为重要的动物学反复中体现重要功能，包括丝氨酸剪裁、mRNAmRNA、DNA 损伤修复以及蛋白质组耐用性等，但其如何被精确mRNA的系统对尚不确切。m6A 剪裁作为信使 RNA 上丰度最高的剪裁型式，为广泛参与哺乳动物的发育、免疫系统对、肿瘤会更新、糖类分化、以及肿瘤生成和转移等生命反复。然而，目前尚不确切 m6A 是不是能作为 R -loop 中 RNA 成份的本源原则上特征来mRNA R -loop 水平，进而体现各种动物学功能。中科院北京蛋白质组研究课题所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文制作团队合作研究课题，挖掘出 m6A 能稳定 R-loop 的演化成，进而mRNA蛋白质mRNA的有效性中止。这一成就以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线刊发于《细胞会研究课题》（Cell Research）月刊。研究课题制作团队首先通过斑点分子杂交和免疫系统对荧光技术，挖掘出敲低 m6A 及第基转移酶 METTL3 显着降低 R -loop 水平，且该mRNA作用依赖于 METTL3 及第基转移酶活性。随后，制作团队团员借助高效液相色谱倡议质谱技术，挖掘出相较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 成份有更加富含的 m6A 剪裁。进一步借助基于双链 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链免疫系统对合共沉淀核酸测序技术（ssDRIP-seq），挖掘出调高的 R -loop 主要富含在mRNA中止区域，R-loop 变化程度与 m6A 的靠近和剪裁水平相关。为了冒险 m6A 对 R -loop mRNA的动物学功能，研究课题制作团队绘制了 RNA 一氧化氮mRNA蛋白质座的图像图谱，并在 MYC、ACTIN 蛋白质上进行多种mRNA活性检测，挖掘出 m6A 促进 R -loop 演化成是mRNA中止阶段的更为重要步骤，可以防止 RNA 一氧化氮的mRNA通读。最后，制作团队团员构建了针对mRNA通读的报告蛋白质系统对，通过 m6A 剪裁蛋白质座的蛋白质进一步证实 m6A 对于 R -loop 演化成及mRNA中止的更为重要作用。该研究课题挖掘出了 m6A 及第基化剪裁的合共mRNAmRNA功能，揭示了 RNA 及第基化剪裁对丝氨酸骨架的影响，以及 R-loop 骨架中的 RNA 成份被剪裁后对其自身二阶的mRNA系统对，阐释了 m6A 通过稳定 R-loop 而促进mRNA短时间中止的现象，为进一步研究课题 m6A 与 R-loop 的mRNA系统对和相应动物学功能提供者了原则上的技术和观点支撑。该研究课题得到了中国科学院战略性先导新能源专项、国家所人文学科以及国家所重点研发计划书等基金赞助。原始中有：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).