Nat Biotechnol :深度解释!科学家成功清楚地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-11-22 03:11:40 来源:
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全因,一项发表在国际性杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究工作报告里,来自欧洲分子生物学研究中心等部门的研究工作者们通过研究工作将生命小肠有机体第一组里所有目前为止的芽孢DNA第一组汇编成了一个大型的索引,从而就能设法研究工作医务人员深入即使芽孢DNA和蛋白之间的关联,以及其对生命身心健康的严重影响。

芽孢密布代谢物内外,其能够产生核酸来严重影响舰载机消化、身心健康和对营养不良的易感性,其如此普遍存在以至于人体有机体第一组成员的存量要比人肝细胞还要多,包括芽孢、细菌和其它有机体;为了阐释芽孢在生命生物学里所扮演着的极为重要角色,研究工作者们举例来说会在研究中心里分离并对其培养,随后在对芽孢进行时DNADNA组,然而现有很多芽孢还无法在研究中心的环境里被培养捕食。

为了拿到这些芽孢的相关的资讯,研究工作医务人员实施了另内外一种步骤,他们从环境里(比如小肠)收集基本上比对,随后在对整个比对里的DNA进行时DNA组,然后可视化步骤对来自基本上比对里的数千种群族的性状DNA第一组进行时修葺,这种步骤被称之为聪DNA第一组学技术开发,该技术开发能作为一种替代步骤对单个群族的DNA进行时分离和DNA组。

研究工作者Rob Finn透露,去年包括我们在内的三个分立团队修葺了成百上千个小肠有机体第一组DNA第一组,而最小的问题就是这些团队所得到的结果有否有着关联性,以及有否能将这些结果汇编成为一个非常全面的清单。现有研究工作医务人员现在从生命小肠里超过4600种芽孢群族里汇编了20万个DNA第一组和1.7亿个核酸序列,这种新型的索引(独立的生命胃小肠DNA第一组可数和独立的胃小肠核酸目录)揭示了舰载机小肠的巨大丰富性,并为进一步进行时小肠有机体第一组研究工作过渡到了道路。

研究工作者所画出的这个巨大的目录是有机体第一组研究工作的一个先行者,下一代或将能为研究工作者们给予非常难得的海洋资源来研究工作生命小肠生态系统里每一种芽孢所扮演着的极为重要角色。这项研究工作证明,超过70%被检查到的芽孢从而在研究中心里被成功培养过,而其在体内的活性仍然相符,而这类芽孢里最小的群体就是Comantemales;研究工作者透露,看到Comantemales如此相当多真是一个兴奋,这就特别强调了我们的确对小肠里的芽孢相去甚远,我希望这个目录能设法生物的资讯学家和免疫学在下一代几年弥补这一专业知识空白。

该索引/目录收集的所有数据库都能在离线海洋资源Mgnify里拿到,其能设法研究工作者们分析有机体的DNA第一组数据库并且与当前的索引进行时对比;随着国内外研究工作团队不断发表新的索引,该目录不必要增大到包括其它舰载机躯干的有机体第一组,比如皮肤上或口腔内外等躯干。先前研究工作者透露,这一目录的汇编下一代或为昆虫学家和临床研究工作医务人员给予非常丰富的海洋资源,然而研究工作医务人员不必要在中美洲、南亚和南美等代表性不足的邻近地区挖掘出更多新的芽孢群族,现有研究工作医务人员并不清楚并不相同人群里芽孢丰富性的差异和改变情况。

原始出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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